Я думаю, что причина этих недоразумений в том, что инсталляторы этих апдейтов не спрашивают пользователя куда их НУЖНО инсталлить, а инсталятся ПО ДЕФОЛТУ в папку Program Files того диска откуда запущена текущая Винда.
Мне пришлось просто потом перенести проинсталеный софт туда где он у меня всегда и жил и выбросить новые ярлыки на рабочий стол!