Может не в тему, но была похожая ситуация: HTC E9 (вроде), Sprint. После разблокировки от сети решил попробовать фичу типа конвертации в европейскую версию через xtc2clip. Моей ошибкой было не сделать перед этим делом S-Off. В результате - ситуация, как у Вас. Только fastboot и все. Связался с разрабом clip'а. Он объяснил где находится тестпоинт, переводящий аппарат в 9008, и по удаленке сделал s-off. Далее, через fastboot восстановил нормальную работу телефона.
Уверен, что S-off поможет Вам сдвинуться с мертвой точки. Можно, как вариант, попробовать вызвонить ТП на плате и попробовать что-нибудь слить/залить через тот же CM2 Qualcomm. Если проканает - поищу Вам донора, сделаю S-off и скину дамп нужного раздела. Крайний вариант - снова снимать память и заливать правленный дамп.