Суть проблемы понял, но не четко, да и советовать вам мне нечего, т.к. в данной ситуации не был.
1. Смотрите можно найти ваш backip созданный iTunes и расковырять его (по крайней мере раньше так делал)
2. itools можно использовать для backup приложений iOS с вашего iOS девайса как просто приложение, так и приложение с вашими данными. Ну это как вариант спасения ваших приложений. Но естественно для актуальных приложений которыми вы сейчас пользуетесь.