Паш, не может быть и usb и uart на одном порту одновременно, какой бы кабель не использовался, просто либо софт криво написан, либо товарищ неправильно что-то делает. В z3x например, выбирается порт uart, а подключение по usb прога находит сама, сканируя подключения. Возможно и в этой проге нужно поступить таким же образом.