То что "обмен проца с периферией не происходит или происходит не корректно"
необязательно проблема по железу, проц не просто железка, а контролер прошитый под конкретные нужды )))
Плохо что нет донора, можете только Gazoo подкинуть с 6700 для проверки.
Если проц - с 6700, будет такой-же "коматоз" (при наличии контрольных напряжений)
То что 6700 запустится с процессором снятым с Е52 - не верю. (будут такиеже симптомы т.е. похожий коматоз)
Все синхросигналы, нормальные (по напряжению и длительности) осцилограммы контрольных точек -
Вы сможете наблюдать - если подкините с рабочего донора (Е52) процессор и флеш (аккуратно, часто дохнут)

Вообщем если хотите совета: поставьте на Е52 родной бутер, прошейте прошивой blank от Е51 или Е66 по FBUS
...Или хотябы свежую прошивку Фениксом
Если лог будет неудачным - замените бутер (согласен, плата тонкая и после удара например могли порваться связи
но чаще в этих аппапратах с новыми RapuYama и СТ-флешками дохнут именно они)

ОФФтопик: Вам не скажут что это связанно с WLAN, ВТ или GPS, лучше не воюйте с телом - подружитесь Напомню, это всего-лишь моё мнение ))))