BEST стирает в режиме "whole flash" - то есть весь чип от и до.
После стирания и прошивки - необходимо включать и проверять тел на работоспособность.
После уже - вливать все - если после чего-то он не включился - стирать это и смотреть что именно не так, есть возможность работать с каждым сертификатом отдельно.