Моё ИМХО.
FreeBSD - стабильность, а она будет нужна всегда.
Fedora - хм.. я это на сервер ставить бы не стал, по причине того, что проще gentoo, потому что в генту добавляешь нужное, а из федоры выкидываешь, плюс не понятная поддержка отдельных сетевых вещей(gre, vlan, etc..)
CentOS - не до RH смешаный с debian, тут мне больше сказать нечего.
RH - безусловно круто, даже очень, НО лишний пафос. Хотя иногда очень не хватает той самой поддержки за которую платят деньги.
Лично я вочти везде ставлю Debian естественно без X'ов, из-за того, что поддержка оборудования у него нормальная, да и база пакетов не маленькая.

ps: Всё и даже больше, зависит от задачи под которую нужна ось, допустим на файлохранилку я никогда не постывлю фряху, ибо ФС очень медленная.

pps: Не хочу холиваров, но еси что могу пояснить.

ppps: Повторюсь, всё зависит от задач.