Да блин, все проще простого. Исполни просто скрипт из под сетоола.

чтение пакета настроек (customization pack) в zip файл: readpkg:/phone/dir
запись сохранненого пакета: writepkg:/package.zip

ну а вообще , если незнаешь что и где лежит выполни просто listdirs: и он тебе покажет содержимое файловой системы тела. Посмотри где там твои темы и сохрани эту директорию командой readpkg:/system/user/Theam/ ( к примеру).

P.S. Вроде такое надо, в папке "ph_out" будут лежать все файлы из FS нашего тела
readdir:/tpa/
readdir:/sys/
readdir:/boot/
readdir:/ifs/
readdir:/system/
readdir:/usb/
readdir:/QUEUE/