Обязательно поробовать поставить последнюю версию драйверов чипсета (Chipset software Installation Utility & Chipset Device Software) версии 9.1.1.1020
http://www.station-drivers.com/page/intel%20chipset.htm
А так же драйвера Matrix Storage Manager версии 9.5.0.1037
http://www.station-drivers.com/page/intel%20raid.htm
Перегрузить компьютер, и посмотреть, есть ли изменения в лучшую сторону.
Так же установить все обновления системы.
Посмотреть в диспетчере устройств, в IDE ATA/ATARI контроллеры, в каком режиме работет винт. Если в PIO, то будут проблемы и зависания при обращении. Надо чтобы в Ultra DMA работал.
Кстати, если SATA винты работают в режиме AHCI под Windows 7, то скорость копирования с винта на другой винт возрастает почти в два раза, по сравнению с режимом IDE. Включается в БИОСЕ компьютера. Процедура переключения много где описана.