Так и есть, это программная проблема.

Пролил дамп с рабочего тела (не свой, нашел на просторах интернета), результат - компьютер стал определять USB-Устройство. Данные бута при этом различаются со стандартными. После заливки стандартного бута (~1.4 Mb), - все вернулось в первоначальное положение. Так что проливка - не помогает.